Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARXQ96QS3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms