Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms