Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms