Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCMH1Q96GD3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms