Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTV1Q96GA3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms