Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BICD1Q96G01 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BICD1Q96G01 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms