Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ROPN1LQ96C74 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms