Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPTSSAQ969W0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms