Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCE1Q969G3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms