Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF3Q92576 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms