Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPDL3AQ92484 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPDL3AQ92484 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms