Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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