Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4L4Q8WXT5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4L4Q8WXT5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms