Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRRN4Q8WUT4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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