Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA6DQ8NFY4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA6DQ8NFY4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA6DQ8NFY4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SEMA6DQ8NFY4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SEMA6DQ8NFY4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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