Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF248Q8NDW4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms