Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms