Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CLDN19Q8N6F1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CLDN19Q8N6F1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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CLDN19Q8N6F1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CLDN19Q8N6F1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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CLDN19Q8N6F1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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