Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD163Q86VB7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD163Q86VB7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD163Q86VB7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD163Q86VB7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms