Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM5Q71RC9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM5Q71RC9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms