Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SDE2Q6IQ49 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms