Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms