Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SDK2Q58EX2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms