Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms