Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC184Q52MB2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC184Q52MB2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms