Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF4Q2M2E3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms