Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC27Q2M243 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms