Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPP1Q1MSJ5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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