Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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