Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECM1Q16610 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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