Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCBQ16585 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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