Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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GABRA6Q16445 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GABRA6Q16445 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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