Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ZFHX3Q15911 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms