Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
NCOA1Q15788 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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NCOA1Q15788 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA1Q15788 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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