Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BECN1Q14457 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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