Protein–RNA interactions for Protein: Q14146

URB2, Unhealthy ribosome biogenesis protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2Q14146 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
URB2Q14146 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
URB2Q14146 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
URB2Q14146 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
URB2Q14146 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
URB2Q14146 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms