Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHROOM2Q13796 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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SHROOM2Q13796 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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