Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms