Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEX6Q13608 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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