Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF5Q13568 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms