Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms