Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXE3Q13461 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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