Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN3Q13286 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN3Q13286 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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