Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IFT88Q13099 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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IFT88Q13099 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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