Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK3Q13003 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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