Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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