Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNIP3Q12983 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms