Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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