Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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NFIAQ12857 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIAQ12857 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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