Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGM3Q08188 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms